To Τμήμα Φαρμακευτικής έχει υιοθετήσει από τη δεκαετία του 1990 και ενισχύει συστηματικά το πρόγραμμα κινητικότητας ERASMUS. Οι όροι για τη συμμετοχή και τα κριτήρια επιλογής των φοιτητών, αναφέρονται στην ιστοσελίδα του ΕΚΠΑ. Στην ίδια ιστοσελίδα αναφέρονται και τα συνεργαζόμενα με το ΕΚΠΑ Ιδρύματα του Εξωτερικού (πρόγραμμα κινητικότητας ERASMUS). Ειδικότερα, το Τμήμα Φαρμακευτικής συμμετέχει στο πρόγραμμα ανταλλαγών φοιτητών έχοντας αναπτύξει συνεργασίες με 30 ευρωπαϊκά πανεπιστήμια από 11 διαφορετικές χώρες (Πίνακας συνεργαζόμενων Πανεπιστημίων). Το Τμήμα Φαρμακευτικής ενημερώνει εγκαίρως τους φοιτητές του σχετικά με την συμμετοχή τους στο πρόγραμμα μέσω ανακοινώσεων στην κεντρική ιστοσελίδα του. Στη συνέχεια προβαίνει σε δυο ενημερωτικές συναντήσεις ανά ακαδημαϊκό έτος ώστε να διευκρινιστούν οι όροι και οι προϋποθέσεις συμμετοχής σε όλους τους φοιτητές που προτίθενται να συμμετάσχουν. Αφού ολοκληρωθεί η περίοδος των αιτήσεων συντάσσεται κατάλογος υποψηφίων κατά σειρά μοριοδότησης, ο οποίος αναρτάται στην ιστοσελίδα του Τμήματος και κοινοποιείται στο γραφείο Erasmus του ΕΚΠΑ.
Οι όροι, οι προϋποθέσεις και τα κριτήρια ορίζονται κεντρικά από το ΕΚΠΑ (πρόγραμμα κινητικότητας ERASMUS)
Το Τμήμα Φαρμακευτικής, στο πλαίσιο του προγράμματος κινητικότητας ERASMUS έχει ακολουθήσει την οικονομική ενίσχυση που προσφέρει το πρόγραμμα. Επιπλέον χρηματοδότηση προβλέπεται από το πρόγραμμα ERASMUS για τους Φοιτητές με Αναπηρία (ΦμεΑ). Το Τμήμα δεν παρέχει πρόσθετη οικονομική ενίσχυση στους φοιτητές που συμμετέχουν σε προγράμματα κινητικότητας.
Το Πρόγραμμα Erasmus αποτελεί μέρος του Ευρωπαϊκού Προγράμματος «Δια Βίου Μάθησης» (Lifelong Learning Programme - European Commission, http://ec.europa.eu/education/lifelong-learning-programme_el) και είναι το βασικό Πρόγραμμα Εκπαίδευσης και Κατάρτισης της Ευρωπαϊκής Ένωσης (Ε.Ε.) που αποσκοπεί τόσο στην ενθάρρυνση και υποστήριξη της κινητικότητας φοιτητών και διδασκόντων, όσο και στην ενίσχυση της συνεργασίας μεταξύ των Ιδρυμάτων Τριτοβάθμιας Εκπαίδευσης. Το Τμήμα Φαρμακευτικής για να ενισχύσει και να ενθαρρύνει τους φοιτητές του στη συμμετοχή σε προγράμματα κινητικότητας, οργανώνει σε ετήσια βάση, ημερίδα ενημέρωσης πάνω στο πρόγραμμα, κατά την οποία οι φοιτητές ενημερώνονται επίσημα για τη σωστή αξιοποίηση και τις δυνατότητες του προγράμματος.
Το Τμήμα Φαρμακευτικής εφαρμόζει το σύστημα μεταφοράς πιστωτικών μονάδων (ECTS). Για κάθε εξάμηνο φοίτησης σε πανεπιστήμιο του εξωτερικού ο φοιτητής μπορεί να αναγνωρίσει έως και 30 πιστωτικές μονάδες (ECTS).